## page was renamed from Vloga celičnega lipidnega metabolizma pri amiotrofični lateralni sklerozi in frontotemporalni lobarni degeneraciji = Vloga celičnega lipidnega metabolizma pri amiotrofični lateralni sklerozi in frontotemporalni lobarni degeneraciji = <
> ''[[ARRSProjekti/2017/SeznamARRSProjekti2017|Nazaj na seznam za leto 2017]]'' ---- === Oznaka in naziv projekta === Z3-7307 - Vloga celičnega lipidnega metabolizma pri amiotrofični lateralni sklerozi in frontotemporalni lobarni degeneraciji<
>Z3-7307 - The role of cellular lipid metabolism in amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal lobar degeneration === Logotipi ARRS in drugih sofinancerjev === {{attachment:ARRS_logotip.jpg|© Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije|height="150"}} === Projektna skupina === Vodja projekta: '''dr. Anja Pucer Janež''' === Vsebinski opis projekta === Amiotrofična lateralna skleroza (ALS) je nevrodegenerativna bolezen, za katero je značilna postopna izguba motoričnih nevronov. Prizadeti so tako nevroni v motoričnem korteksu kot nevroni v možganskem deblu in hrbtenjači, kar vodi do oslabitve mišic, mišične atrofije in končno do paralize. Frontotemporalna lobarna degeneracija (FTLD) je kronično napredujoča bolezen, pri kateri pride do degeneracije v frontalnem in temporalnem režnju možganov, kar se odraža v vedenjskih motnjah in težavah z govorom. Klinični, genetski in epidemiološki podatki kažejo, da predstavljata ALS in FTLD dva konca kompleksnega spektra bolezni. TDP-43 predstavlja eno glavnih komponent ubikvitiniranih agregatov proteinov v centralnem živčnem sistemu bolnikov z ALS/FTLD, poznanih kot ključni patološki znak bolezni ALS in FTLD, zato te bolezni imenujemo tudi TDP-43-proteinopatije. Dedno obliko bolezni ALS/FTLD so povezali z mutacijami v več kot 50 potencialnih genih, vključno z geni, ki kodirajo encim superoksid-dismutazo 1 (''SOD1''), protein TDP-43 (''TARDBP'') ter protein fused in sarcoma (''FUS''). Pred nedavnim so identificirali ponovitve zaporedja šestih nukleotidov v genu ''C9ORF72'' in te mutacije opredelili kot najpogostejši vzrok dednih oblik ALS in FTLD. Ena od glavnih hipotez, ki ponuja razlago za patološke vplive podaljšanih ponovitev v genu ''C9ORF72'', predlaga akumulacijo agregatov patogenih proteinov z dipeptidnimi ponovitvami (DPR) in številne študije dokazujejo, da so proteini DPR nevrotoksični ''in vitro''. Lipidne kapljice (LK) so dinamične strukture, ki se nahajajo v vseh vrstah celic. Sestavljene so iz hidrofobne sredice iz nevtralnih lipidov, ki se od citosola ločuje z enojnim slojem fosfolipidov. Novejše študije dokazujejo, da imajo LK širšo vlogo v celicah, kot je bilo opisano do sedaj. LK lahko modulirajo razpoložljivost proteinov in signalnih lipidov v celičnem jedru, imajo pomembno vlogo pri znotrajceličnem procesiranju maščobnih kislin, poleg tega pa njihovo pomanjkljivo delovanje v nevronih in celicah glie lahko privede do nevrodegeneracije. Namen predlaganega projekta je prispevati k razumevanju potencialnih molekulskih interakcij med agregiranimi proteini DPR, TDP-43 in FUS, povezanimi z ALS/FTLD, in celičnimi LK, kar lahko potencialno vpliva na patološki mehanizem omenjenih proteinov. Na celičnih modelih bomo z uporabo konfokalne mikroskopije proučevali lokalizacijo LK in proteinov povezanih z ALS/FTLD. Nadalje bomo določili vpliv morebitnih interakcij med proteini TDP-43, FUS in DPR ter LK na viabilnost celic, celično preživetje, mitohondrijski potencial in nastanek reaktivnih kisikovih zvrsti. LK, ki se v celicah kopičijo zaradi dodatka različnih maščobnih kislin, se lahko razlikujejo v svoji sestavi in zato različno vplivajo na signalne procese v celicah. Pri našem delu bomo analizirali morebiten vpliv LK, ki nastanejo zaradi dodatka različnih maščobnih kislin k modelnim celičnim kulturam, na patogenezo pri ALS/FTLD. Osnovni podatki sofinanciranja so dostopni na spletni strani [[http://www.sicris.si/|SICRIS]]. === Faze projekta === 1. V prvi fazi projekta bomo analizirali interakcije med proteini z dipeptidnimi ponovitvami, TDP-43 in FUS ter lipidnimi kapljicami v različnih modelnih celičnih linijah s pomočjo konfokalne mikroskopije. 1. V drugi fazi projekta bomo analizirali vpliv lipidnih kapljic v citosolu celic na nevrotoksičnost proteinov povezanih z ALS/FTLD. 1. V tretji fazi projekta bomo proučevali, kako spremembe v sestavi lipidnih kapljic vplivajo na različne signalne poti v celičnem modelu ALS/FTLD. 1. Da bi pridobili širši vpogled v molekularne interakcije proteinov DPR v sesalskih celicah, smo v naše raziskovalno delo dodatno vključili obširno analizo interaktorjev proteinov DPR. Na ta način smo z drugačnim metodološkim pristopom želeli pokazati interakcije proteinov DPR s celotnim naborom proteinov v celicah in tako preveriti tudi morebitne interakcije med proteini DPR in proteini, vpletenimi v lipidni metabolizem. === Bibliografske reference === * [[http://www.sicris.si/public/jqm/cris.aspx?lang=slv&opdescr=home&opt=1|SICRIS]] * PUCER JANEŽ, Anja, PRPAR MIHEVC, Sonja, KOVANDA, Anja, MALNAR, Mirjana, PETAN, Toni, ROGELJ, Boris. Localization of dipeptide repeat proteins and their interaction with lipid droplets in human cells. V: GORIČAR, Katja (ur.), HUDLER, Petra (ur.). Book of abstracts = Zbornik povzetkov, 12th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 12. Srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Bled, 20-23 September 2017. <
> [COBISS.SI-ID [[https://plus.si.cobiss.net/opac7/bib/30940711|30940711]]] * PUCER JANEŽ, Anja, PRPAR MIHEVC, Sonja, KOVANDA, Anja, MALNAR, Mirjana, PETAN, Toni, ROGELJ, Boris. Localization of dipeptide repeat proteins and their interaction with lipid droplets in model cell lines. V: MATKOVIČ, Andraž (ur.), BRESJANAC, Mara (ur.). Book of abstracts. Ljubljana: Sinapsa, Slovenian Neuroscience Association. 2017, str. 59. <
> [COBISS.SI-ID [[https://plus.si.cobiss.net/opac7/bib/30941479|30941479]]] * PUCER JANEŽ, Anja, BOŽIČ, Janja, MARKIČ, Lara, MOTALN, Helena, ROGELJ, Boris. Identification of dipeptide repeat proteins interacting protein targets by proximity-dependent labeling. V: KISOVEC, Matic (ur.). ''Book of abstracts = Knjiga povzetkov''. 13th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 13. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Dobrna, 24 - 27 September 2019. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2019. Str. 140. ISBN 978-961-93879-8-6. [COBISS.SI-ID [[https://plus.si.cobiss.net/opac7/bib/32852007?lang=si|32852007]]] * PUCER JANEŽ, Anja, BOŽIČ, Janja, MARKIČ, Lara, MOTALN, Helena, ROGELJ, Boris. Identification of dipeptide repeatproteins interactome by proximity-dependent labeling. V: RITUPER, Boštjan (ur.), KORITNIK, Blaž (ur.). ''Book of abstracts''. SiNAPSA Neuroscience Conference '19 - SNC'19, Ljubljana, Slovenia 20-21 September. Ljubljana: SiNAPSA, Slovenian Neuroscience Association, 2019. Str. 55. ISBN 978-961-91704-9-6. [COBISS.SI-ID [[https://plus.si.cobiss.net/opac7/bib/32885287?lang=si|32885287]]] * PUCER JANEŽ, Anja, BOŽIČ, Janja, MARKIČ, Lara, MOTALN, Helena, ROGELJ, Boris. Identification of dipeptide repeat proteins interactome by proximity-dependent labeling with BioID2. V: ''RNP network dynamics in development and disease : abstract book''. EMBO Workshop, 29 September - 2 October 2019, Ljubljana, Slovenia. [S. l.: s. n.], 2019. Str.152. [COBISS.SI-ID [[https://plus.si.cobiss.net/opac7/bib/32860199?lang=si|32860199]]] ---- [[ARRSProjekti/SeznamARRSProjekti|Nazaj na seznam projektov po letih]]