Nove protimikrobne strategije preprečevanja tvorbe biofilma z uporabo lektinov, ki inhibirajo bakterijsko adhezijo
Oznaka in naziv projekta
J4-1771 Nove protimikrobne strategije preprečevanja tvorbe biofilma z uporabo lektinov, ki inhibirajo bakterijsko adhezijo
J4-1771 New antimicrobial strategies in prevention of biofilm formation by using lectins that inhibit bacterial adhesion
Logotipi ARRS in drugih sofinancerjev
Projektna skupina
Vodja projekta: dr. Jerica Sabotič
Sodelujoče raziskovalne organizacije: Povezava na SICRIS
Sestava projektne skupine: Povezava na SICRIS
Vsebinski opis projekta
Alternativni pristop za omejitev naraščajočega pojava odpornosti proti antibiotikom je boj proti bakterijskim okužbam s preprečevanjem prvega stika bakterij s površinami, in sicer bakterijske adhezije in nadaljnje tvorbe biofilma. V tem projektu se bomo osredotočili na patogeno Gram-pozitivno bakterijo Listeria monocytogenes (Lm) kot modelni organizem za analizo mehanizmov adhezije preko proteinov, ki vežejo glikane - lektinov (tako endogenih kot eksogenih), saj bakterijski površinski glikani močno vplivajo na interakcijo bakterij s površinami. Drugi cilj predlaganega projekta je razviti izboljšano metodo za preučevanje adhezije bakterij in tvorbe biofilma z uporabo fluorescence ali luminiscence v mikrofluidni platformi, ki bo omogočala zgodnjo detekcijo biofilmov.
Lm povzroča listeriozo, ki je zaradi zelo visoke stopnje smrtnosti najhujša zoonoza v EU. Prenaša se z uživanjem kontaminirane hrane, saj Lm lahko preživi in raste v kislih, slanih in hladnih pogojih in se pogosto nahaja na gotovih živilih, v mlečnih izdelkih, na surovi zelenjavi in sadju, ker zelo uspešno kolonizira okolja za predelavo hrane. Neverjetna vztrajnost Lm je razvidna iz zadnjih več let trajajočih izbruhov v EU, ki obsegajo več držav. En je bil na primer povezan z zamrznjeno koruzo in drugo zelenjavo iz enega predelovalnega obrata, drugi pa je povezan s pripravljenimi lososovimi izdelki.
Prvi korak pri tvorbi biofilma je adhezija planktonskih bakterij na površino, ki ji sledi celična proliferacija in proizvodnja zunajceličnih polimernih snovi (EPS). Za razliko od biofilmov mnogih drugih bakterij, kjer prevladujejo polisaharidi, so v zunajceličnem matriksu Lm proteini najbolj zastopani in so tudi najpomembnejše determinante adhezije in nadaljnjega razvoja in vzdrževanja biofilma. Zato se bodo naše raziskave osredotočile predvsem na proteine iz EPS-a. Naši predhodni rezultati so pokazali, da več izoliranih gobjih lektinov vpliva na adhezijo bakterij na polistiren.
Potek dela bo vključeval pripravo funkcionalnih rekombinantnih lektinov iz višjih gliv in sočasen razvoj izboljšane metode za preučevanje adhezije bakterij in tvorbe biofilma z uporabo fluorescenčnih bakterij in mikrofluidne platforme, ki omogoča časovno spremljanje in uporabo konfokalne mikroskopije. Z uporabo novo razvitih izboljšanih metod bomo ovrednotili učinke izbranih lektinov na adhezijo na abiotske in biotske površine v statičnih in dinamičnih biofilmih. Temu bo sledila identifikacija tarčnih in drugih molekul, vključenih v adhezijo in tvorbo biofilma, vključno z analizo EPS in arhitekture biofilma. Molekule, ki jih vežejo eksogeni lektini, bomo izolirali z uporabo lektinske afinitetne kromatografije in endogene lektine bodo identificirali s kompetitivnim testom z glikani. Nazadnje bomo opisali mehanizem procesa adhezije z validacijo tarčnih molekul in predlagali bomo nove strategije za preprečevanje kontaminacije površin z Lm.
Osnovni podatki sofinanciranja so dostopni na spletni strani. Povezava na SICRIS.
Faze projekta in opis njihove realizacije
1: Priprava funkcionalnih rekombinantnih gobjih lektinov
Cilj prvega delovnega sklopa smo v celoti izpolnili in celo presegli s številom lektinov, ki smo jih vključili v analize v okviru drugih delovnih sklopov. Pripravo lektinov in njihovo karakterizacijo smo objavili v več člankih in prispevkih na konferencah.
2: Razvoj izboljšane metode za analizo bakterijske adhezije in tvorbe biofilma
Vzpostavili in razvili smo nove metode za vrednotenje tvorbe biofilma tako z uporabo fluorescenčnih in bioluminiscenčnih bakterij v statičnih in dinamičnih pogojih. Poleg tega smo razvili tudi metodo za enostavnejše sledenje razvoja biofilmov z uporabo merjenja optične gostota, kjer uporaba barvil oziroma označevalnih proteinov ni potrebna. Razvoj mikrofluidne platforme za spremljanje razvoja biofilmov je omogočila vpogled v molekularne procese v realnem času in bolj poglobljeno razumevanje teh procesov. Izsledke smo objavili v več raziskovalnih člankih in prispevkih na konferencah.
3: Analiza vpliva izbranih gobjih lektinov na adhezijo in tvorbo biofilma
Preverili smo učinek lektinov na adhezijo listerij tako na polistiren kot na modelne biotske površine in človeške celične linije, ki predstavljajo različne faze okužbe. Prav tako smo za izbrane lektine preverili tudi učinke na tvorbo in razbijanje dinamičnega biofilma ter procese spremljali v realnem času z uporabo fluorescenčno označenih listerij.
4: Identifikacija molekul, ki sodelujejo pri adheziji in tvorbi biofilma
Cilj četrtega delovnega sklopa je bila identifikacija molekul, ki sodelujejo pri adheziji in tvorbi biofilma. Iz tega področja smo najprej pripravili pregledni članek o poznanih strukturah na površini listerij, nadalje pa smo z uporabo lektinov potrdili, da so glikani pomembne strukture, ki so vpletene v adhezijo in/ali razvoj biofilmov pri listerijah. Pokazali smo tudi kateri lektini vplivajo na arhitekturo biofilma in določili smo novo strukturo tejhojskih kislin vrste L. innocua, ki je nakazala na večjo raznolikost teh struktur pri tej vrsti, kot je bilo do zdaj prikazano v literaturi.
5: Analiza mehanizma adhezije
V petem delovnem sklopu namenjenim analizi mehanizma učinkov lektinov na tvorbo biofilma smo potrdili, da je za učinek pomembna vezava glikanov, kar smo potrdili s kompetitivnimi testi in uporabo mutantov izbranih lektinov. Na ta način smo validirali, da so tarčne molekule res glikani, za nadaljnje raziskave pa ostaja še karakterizacije strukture teh glikanov. Pristop za uporabo lektinov za proučevanje razvoja biofilma listerij se je izkazal za pravilnega, saj smo potrdili, da so glikani pomembne molekule vpletene v te procese, ki jih z uporabo lektinov lahko spreminjamo. Tarčno spreminjanje interakcij s pomočjo lektinov tako predstavlja pomemben element novih strategij za preprečevanje kontaminacije površin z listerijami.
Bibliografske reference
Izvirni znanstveni članki
BERLEC, Aleš, JANEŽ, Nikolaja, STERNIŠA, Meta, KLANČNIK, Anja, SABOTIČ, Jerica. Listeria innocua biofilm assay using NanoLuc Luciferase. Bio-protocol. 2022, vol. 12, iss. 3, str. e4308-1-e4308-9. ISSN 2331-8325. DOI: 10.21769/BioProtoc.4308. [COBISS.SI-ID 96667907]
BELLICH, Barbara, JANEŽ, Nikolaja, STERNIŠA, Meta, KLANČNIK, Anja, RAVENSCROF, Neil, RIZZO, Roberto, SABOTIČ, Jerica, CESCUTTI, Paola. Characterisation of a new cell wall teichoic acid produced by Listeria innocua ŽM39 and analysis of its biosynthesis genes. Carbohydrate research. [Print ed.]. Jan. 2022, vol. 511, str. 1-8, art. 108499, ilustr. ISSN 0008-6215. DOI: 10.1016/j.carres.2021.108499. [COBISS.SI-ID 92040451]
STERNIŠA, Meta, SABOTIČ, Jerica, KLANČNIK, Anja. A novel approach using growth curve analysis to distinguish between antimicrobial and anti-biofilm activities against Salmonella. International journal of food microbiology. [Print ed.]. 2022, vol. 364, str. 1-11, art. 109520, ilustr. ISSN 0168-1605. DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2021.109520. [COBISS.SI-ID 92026115]
RENKO, Miha, ZUPAN, Tanja, PLAZA, David F., SCHMIEDER, Stefanie S., PERIŠIĆ, Milica, KOS, Janko, TURK, Dušan, KÜNZLER, Markus, SABOTIČ, Jerica. Cocaprins, β-trefoil fold inhibitors of cysteine and aspartic proteases from Coprinopsis cinerea. International journal of molecular sciences. 2022, vol. 23, iss. 9, str. 4916-1-4916-15, ilustr. ISSN 1661-6596. DOI: 10.3390/ijms23094916. [COBISS.SI-ID 106176771]
BERLEC, Aleš, JANEŽ, Nikolaja, STERNIŠA, Meta, KLANČNIK, Anja, SABOTIČ, Jerica. Expression of NanoLuc luciferase in Listeria innocua for development of biofilm assay. Frontiers in microbiology. Feb. 2021, vol. 12, str. 636421-1-636421-9. ISSN 1664-302X. DOI: 10.3389/fmicb.2021.636421. [COBISS.SI-ID 49628675]
Pregledni znanstveni članek
JANEŽ, Nikolaja, ŠKRLJ, Blaž, STERNIŠA, Meta, KLANČNIK, Anja, SABOTIČ, Jerica. The role of the Listeria monocytogenes surfactome in biofilm formation. Microbial biotechnology. [Online ed.]. Jul. 2021, vol. 14, iss. 4, str. 1269-1281, ilustr. ISSN 1751-7915. DOI: 10.1111/1751-7915.13847. [COBISS.SI-ID 67146499]
Strokovni članek
SABOTIČ, Jerica. Imajo gobe imunski sistem? Molekularni mehanizmi obrambe pri glivah. Proteus : ilustriran časopis za poljudno prirodoznanstvo. [Tiskana izd.]. mar. 2020, letn. 82, [št.] 7, str. 291, 302-309, ilustr. ISSN 0033-1805. http://www.dlib.si/details/URN:NBN:SI:doc-8UQUBVFA. [COBISS.SI-ID 24507139]
Vabljena predavanja
BIRK, Jernej, HOČEVAR, Domen, RANGUS, Kaja, MITROVIĆ, Ana, SABOTIČ, Jerica. Uporaba mikrotermoforeze za določanje vezave sladkorjev na izolektin rCnSLB2. V: BAVEC, Aljoša (ur.), et al. BIOmolekularec.si : dan biomolekularnih znanosti : zbornik povzetkov : Ljubljana, 29. september 2022. Ljubljana: Slovensko biokemijsko društvo, 2022. Str. 18. ISBN 978-961-95941-0-0. [COBISS.SI-ID 123776771]
ZUPAN, Tanja, JANEŽ, Nikolaja, ČOTAR, Petra, SEBASTIJANOVIĆ, Aleksandar, ŠTRANCAR, Janez, SABOTIČ, Jerica. Vpliv kokaprina in makrocipina na biofilm listerij. V: BAVEC, Aljoša (ur.), et al. BIOmolekularec.si : dan biomolekularnih znanosti : zbornik povzetkov : Ljubljana, 29. september 2022. Ljubljana: Slovensko biokemijsko društvo, 2022. Str. 58. ISBN 978-961-95941-0-0. [COBISS.SI-ID 129779203]
SABOTIČ, Jerica, KOS, Janko. The plasticity of the beta-trefoil-type lectins from higher fungi : presented at Symposia on 45th FEBS Congress, Molecules of Life: Towards New Horizons, Ljubljana, Slovenia, July 3-8, 2021. FEBS open bio. 2021, vol. 11, suppl. s1, str. 64. ISSN 2211-5463. DOI: 10.1002/2211-5463.13206. [COBISS.SI-ID 70199043]
Objavljeni povzetki znanstvenih prispevkov na konferencah
TUMPEJ, Tadeja, KARNIČAR, Katarina, TALER-VERČIČ, Ajda, TURK, Dušan, SABOTIČ, Jerica. A platform for high throughput production and purification of recombinant fungal lectins. V: 17th High-Grade Serous Ovarian Cancer, CFGBC 2022 Symposium : hybrid Symposium Slovenia, 6th June 2022 : book of abstracts : electronic version. Str. 48. [COBISS.SI-ID 112011267]
STERNIŠA, Meta, SABOTIČ, Jerica, KLANČNIK, Anja. Distinguishing antimicrobial and anti-biofilm activity of agents using Salmonella Infantis. V: SVILIČIĆ PETRIĆ, Ines (ur.), LEBOŠ PAVUNC, Andreja (ur.), ŠANTIĆ, Marina (ur.). 7th Croatian congress of microbiology with international participation : programme and abstracts : May 24 - 27, 2022 Sveti Martin na Muri, Croatia. Zagreb: Croatian Microbiological Society, 2022. Str. 44, op6. ISBN 978-953-7778-18-7. [COBISS.SI-ID 113384963]
ZUPAN, Tanja, ČOTAR, Petra, SEBASTIJANOVIĆ, Aleksandar, JANEŽ, Nikolaja, ŠTRANCAR, Janez, KOKALJ, Tadej, SABOTIČ, Jerica. In vivo imaging of Listeria innocua biofilm growth in microfluidic device. V: ŠALIĆ, Anita (ur.), et al. IMTB : 6th International conference, 5-8 June 2022, Portorož, Slovenia : book of extended abstracts. Ljubljana: Faculty of Chemistry and Chemical Technology, 2022. Str. 72-73, ilustr. ISBN 978-961-7078-24-4. [COBISS.SI-ID 114915331]
JUG, Blaž, STERNIŠA, Meta, SABOTIČ, Jerica, KLANČNIK, Anja. The reduction of Campylobacter jejuni biofilm by fungal lectins. V: Next generation challenges in food microbiology : abstract book : FoodMicro 2022 [also] 27th International ICFMH Conference, August 28-31 2022, Athens, Greece [and] hybrid. Athens: Hellenic Scientific Society of Mikrobiokosmos, 2022. Str. 118, p1.32. [COBISS.SI-ID 119642371]
ZUPAN, Tanja, RENKO, Metka, KÜNZLER, Markus, KOS, Janko, TURK, Dušan, SABOTIČ, Jerica. A new family of cysteine and aspartic peptidase inhibitors with beta-trefoil fold from fungi. V: KOZAK, Andreja (ur.), et al. Proteolysis at the interface between health and disease : FEBS ICGEB 2022 Advanced Course : 18-21 September, Bled, Slovenia : book of abstracts. Ljubljana: Jožef Stefan Institute, 2022. Str. 18. ISBN 978-961-264-229-7. [COBISS.SI-ID 127331587]
MIHELIČ, Blaž, MEGLEN, Lara, SABOTIČ, Jerica. Effect of temperature on heterologous expression of lectin CnSLB in minimal growth medium : 45th FEBS Congress, Molecules of Life: Towards New Horizons, Ljubljana, Slovenia, July 3-8, 2021. FEBS open bio. 2021, vol. 11, issue s1, str. 149. ISSN 2211-5463. DOI: 10.1002/2211-5463.13205. [COBISS.SI-ID 70170371]
MEGLEN, Lara, MIHELIČ, Blaž, KOS, Janko, SABOTIČ, Jerica. Heterologous expression of fungal lectins in bacterial expression system : 45th FEBS Congress, Molecules of Life: Towards New Horizons, Ljubljana, Slovenia, July 3-8, 2021. FEBS open bio. 2021, vol. 11, issue s1, str. 150. ISSN 2211-5463. DOI: 10.1002/2211-5463.13205. [COBISS.SI-ID 95506691]
SABOTIČ, Jerica, KOS, Janko. Structural and functional glycobiology : presented at virtual event 20th FEBS Young Scientists' Forum, 15-18 June 2021 : programme and abstract book. FEBS open bio. 2021, vol. 11, suppl. s1, str. 151. ISSN 2211-5463. [COBISS.SI-ID 95572995]
JANEŽ, Nikolaja, STERNIŠA, Meta, KLANČNIK, Anja, KOS, Janko, SABOTIČ, Jerica. Listeria innocua biofilm development on abiotic surfaces : 45th FEBS Congress, Molecules of Life: Towards New Horizons, Ljubljana, Slovenia, July 3-8, 2021. FEBS open bio. 2021, vol. 11, issue s1, str. 265. ISSN 2211-5463. DOI: 10.1002/2211-5463.13205. [COBISS.SI-ID 69783299]
SMOLE MOŽINA, Sonja, STERNIŠA, Meta, PRETNAR, Gaja, TOPLAK, Nataša, KOVAČ, Minka, JERŠEK, Barbara, KLANČNIK, Anja. Anti-adhesion activity of phenolic compounds against Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes evaluated with PCR-based methods. V: MUJČINOVIĆ, Alen (ur.). Book of abstracts : 10th Central European Congress on Food (CEFood) : Sarajevo, June 10-11, 2021. Sarajevo: Faculty of Agriculture and Food Sciences, University of Sarajevo, 2021. Str. 137-138. [COBISS.SI-ID 70510339]
STERNIŠA, Meta, JANEŽ, Nikolaja, KLANČNIK, Anja, SABOTIČ, Jerica. Glycans are involved in adhesion of Listeria to abiotic surfaces. V: 15th CFGBC, Centre for Functional Genomics and Bio-Chips 2020 Event : zoom conference. [COBISS.SI-ID 22138627]
JANEŽ, Nikolaja, ŠKRLJ, Blaž, SABOTIČ, Jerica. Variability of surface proteins among Listeria monocytogenes serotypes affecting its ability to form biofilm in food processing settings. V: 15th CFGBC, Centre for Functional Genomics and Bio-Chips 2020 Event : zoom conference. [COBISS.SI-ID 21907971]
JANEŽ, Nikolaja, ŠKRLJ, Blaž, SABOTIČ, Jerica. Vpliv raznolikosti nabora površinskih proteinov na sposobnost tvorjenja biofilmov Listeria spp. na abiotskih površinah. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 64. ISBN 978-961-90346-8-2. [COBISS.SI-ID 37869315]
STERNIŠA, Meta, JANEŽ, Nikolaja, KLANČNIK, Anja, SABOTIČ, Jerica. Glycans influence the biofilm formation of pathogenic bacteria on abiotic surfaces. V: FEMS online conference on microbiology : 28 - 31 October 2020 : electronic abstract book. Federation of European Microbiological Societies with association with the Serbian Society of Microbiology. Beograd: Serbian Society of Microbiology, 2020. Str. 278. [COBISS.SI-ID 48786947]
KLANČNIK, Anja, JANEŽ, Nikolaja, STERNIŠA, Meta, SABOTIČ, Jerica. Exploring molecular mechanisms of bacterial biofilm formation. V: GAUDÊNCIO, Susana P. (ur.), VASQUEZ, Marlen I. (ur.), ROTTER, Ana (ur.). Ocean4Biotech : CA18238 - European transcidiplinary networking platform for marine biotechnology : book of abstracts. [Piran: s. n.], 2020. Str. 29, oc 17. [COBISS.SI-ID 5176696]
KURET, Neja, STERNIŠA, Meta, KOS, Janko, SMOLE MOŽINA, Sonja, KLANČNIK, Anja, SABOTIČ, Jerica. Fungal lectin KKP affects bacterial adhesion. V: KISOVEC, Matic (ur.). Book of abstracts = Knjiga povzetkov. 13th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 13. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Dobrna, 24 - 27 September 2019. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2019. Str. 81. ISBN 978-961-93879-8-6. [COBISS.SI-ID 4812657]
SABOTIČ, Jerica. Listeria innocua ŽM39 cell wall teichoic acid : presented at 6h Latin American Glycobiology, 5-8 October 2021, Mexico City, online. [COBISS.SI-ID 95560451]
Patentna prijava
STERNIŠA, Meta, SABOTIČ, Jerica, KLANČNIK, Anja. A method for identifying a composition or compound having antimicrobial and/or anti-biofilm activities against a microorganism of interest : WO 2022/207781 A2, 2022-10-06. [Geneva]: World Intellectual Property Organization, 2022. 40 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 67880451]
Strokovni film
SABOTIČ, Jerica, ROTTER, Ana. Bioassays. [S. l.: Ocean4Biotech], 2022. 1 spletni vir (1 videodatoteka (2 min 1 sek)). https://www.youtube.com/watch?v=y3o2eSPhpD8. [COBISS.SI-ID 105209859]
SABOTIČ, Jerica, ROTTER, Ana. An introduction to microbial biofilms. [S. l.: Ocean4Biotech], 2021. 1 spletni vir (1 videodatoteka (2 min 1 sek)). https://www.youtube.com/watch?v=y3o2eSPhpD8. [COBISS.SI-ID 105204995]
Organizacija dogodkov
KATALINIĆ, Maja (urednik), DULIĆ, Morana (urednik), SINČIĆ, Nino (urednik), SABOTIČ, Jerica (urednik), PIŠLAR, Anja (urednik), DIAZ MORENO, Irene (urednik). FEBS 2021 : The 20th FEBS Young Scientistsʼ forum : virtual event : 15-18 June 2021 : Programme and abstract book. [Zagreb]: The Federation of European Biochemical Societies (FEBS): Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology: Slovenian Biochemical Society, 2021. 1 USB ključ (1 PDF datoteka (161 str.)), ilustr. https://2021.febscongress.org/. [COBISS.SI-ID 67956995]
SABOTIČ, Jerica (urednik, tehnični urednik), KLANČNIK, Anja (urednik, tehnični urednik). NMR in microbial glycobiology : mini symposium : book of abstracts : 24 January 2023 : [Jožef Stefan Institute, The Main Institute Lecture Hall, Jamova 39, Ljubljana]. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2023. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (10 str.)), ilustr. ISBN 978-961-6379-75-5. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=144102. [COBISS.SI-ID 140553731]
Magistrska dela (bolonjski študij)
PESTEREAN, Maria. Modulacija adhezije bakterij Campylobacter in Listeria na modelnih površinah : magistrsko delo. Ljubljana: [M. Pesterean], 2023. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija. [COBISS.SI-ID 144942595]
ZUPAN, Tanja. Vpliv kokaprina in makrocipina na biofilm listerij : magistrsko delo. Ljubljana: [T. Zupan], 2021. 77 str., ilustr. Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo, Magistrski študijski program 2. stopnje Biokemija. [COBISS.SI-ID 87666691]
VIDIC, Natalija. Kvantifikacija prisotnosti, adhezivnosti in filmotvornosti bakterij vrste Listeria innocua z genom za luciferazo na polistirenski površini : magistrsko delo. Ljubljana: [N. Vidic], 2021. XII, 53 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Živilstvo, 146. [COBISS.SI-ID 78609667]
PRETNAR, Gaja. Kvantifikacija kombiniranega protiadhezijskega delovanja naravnih učinkovin na bakterije vrst Campylobacter jejuni in Listeria monocytogenes z metodami na osnovi PCR : magistrsko delo. Ljubljana: [G. Pretnar], 2018. X, 54 f., [11] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Živilstvo, 65. [COBISS.SI-ID 4919672]
VERTOT, Manca. Zunajcelični polisaharidni sloj bakterij Campylobacter jejuni : magistrsko delo. Ljubljana: [M. Vertot], 2021. X, 60 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 241. [COBISS.SI-ID 87091971]
KURET, Neja. Delovanje lektina kokaprina na patogene in probiotične bakterije : magistrsko delo : [Krkina nagrada za leto 2020]: M. Sc. thesis. Ljubljana: [N. Kuret], 2019. XIII, 80 f., [15] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija. [COBISS.SI-ID 9347193]
Nagrade in priznanja
Krkina nagrada: ZUPAN, Tanja. Vpliv kokaprina in makrocipina na biofilm listerij. V: PLEVNIK, Miha (ur.). 52. Krkine nagrade: zbornik povzetkov: 32. simpozi: [Novo mesto, 21. oktober 2022]. Novo mesto: Krka, [2022]. Str. 110.
Krkino priznanje s posebno pohvalo: VERTOT, Manca. Zunajcelični polisaharidni sloj bakterij Campylobacter jejuni. V: PLEVNIK, Miha (ur.). 52. Krkine nagrade: zbornik povzetkov: 32. simpozij: [Novo mesto, 21. oktober 2022]. Novo mesto: Krka, [2022]. Str. 110.
Zlato priznanje na 55. srečanju mladih raziskovalcev Slovenije: BIRK, Jernej, HOČEVAR, Domen, RANGUS, Kaja. Uporaba mikrotermoforeze za določanje vezave sladkorjev na izolektin rCnSLB2 : (raziskovalna naloga iz interdisciplinarnega področja). Novo mesto: Gimnazija; [Ljubljana]: Institut »Jožef Stefan«, 2021. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (64 str.)), [COBISS.SI-ID 112436739]
Rektorjeva nagrada za naj inovacijo Univerze v Ljubljani 2021: STERNIŠA, Meta, SABOTIČ, Jerica, KLANČNIK, Anja. SIMBA, sočasna detekcija protimikrobnega in protibiofilmskega delovanja.
Krkina nagrada: KURET, Neja. Delovanje lektina kokaprina na patogene in probiotične bakterije. V: PLEVNIK, Miha (ur.). 50. Krkine nagrade: zbornik povzetkov: 30. simpozij: [Novo mesto, 16. oktober 2020]. Novo mesto: Krka, [2020]. Str. 75. [COBISS.SI-ID 33795587]
Bilateralni projekti
Bilateralni projekt IT-SI »Mehanizem delovanja lektina KKP na tvorbo biofilma patogenih in probiotičnih bakterij« (2018-2022). številko BI-IT-18-20-006.
Bilateralni projekt ZDA-SI »Tarčne molekule zunajceličnega matriksa bakterij Campylobacter vključene v adhezijo« BI-US / 19-21-105 project (2020-2021)
Inovacijski sklad (2022-2023) Sočasna detekcija protimikrobnega in protibiofilmskega delovanja učinkovin - razvoj prototipne aplikacije SIMBApp